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SEQF6718.1|JACJSX010000172.1	CCTyper	OPERON	3014	4075	1062	-	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000172.1@1;Genome_ID=SEQF6718.1;Product=Cas Operon;Feature_type=OPERON;Note=Cas Prediction: Type II-D;Complete_Interference=100%;Complete_Adaptation=0%;Best_type=II-D;Best_score=4.0;Genes=Cas9_0_II-D;Positions=3;E-values=4.00e-32;CoverageSeq=0.477;CoverageHMM=0.212;Strand_Interference=-1;Strand_Adaptation=NA
SEQF6718.1|JACJSX010000016.1	CCTyper	OPERON	48254	56425	8172	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000016.1@2;Genome_ID=SEQF6718.1;Product=Cas Operon;Feature_type=OPERON;Note=Cas Prediction: Type III-A;Complete_Interference=100%;Complete_Adaptation=NA;Best_type=III-A;Best_score=16.0;Genes=Cas10_1_CAS-III,Csm2gr11_7_CAS-III-A,Csm3gr7_1_CAS-III-A-III-D,Csm4gr5_1_CAS-III-A,Csm5gr7_0_CAS-III-A-III-D,Cas6_8_CAS-I-II-III-IV-V-VI,Csx1_18_CAS-III;Positions=36,37,38,39,40,41,42;E-values=1.20e-109,5.50e-34,2.00e-73,1.30e-52,3.10e-23,4.80e-18,3.40e-79;CoverageSeq=0.712,0.761,0.844,0.957,0.861,0.597,0.894;CoverageHMM=0.853,0.982,0.991,0.952,0.871,0.549,1.0;Strand_Interference=1;Strand_Adaptation=NA
SEQF6718.1|JACJSX010000057.1	CCTyper	OPERON	14120	27091	12972	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000057.1@1;Genome_ID=SEQF6718.1;Product=Cas Operon;Feature_type=OPERON;Note=Cas Prediction: Type III-D;Complete_Interference=50%;Complete_Adaptation=NA;Best_type=III-D;Best_score=10.0;Genes=Cas10_7_CAS-III,Csm3gr7_12_CAS-III-A-III-D,Csx19_1_CAS-III-D,Csm3gr7_4_CAS-III-A-III-D,Csm6_2_CAS-III,Csm6_2_CAS-III,Cas1_0_I-II-III,Cas2_2_CAS-I-II-III-IV-V-VI;Positions=12,14,16,17,18,19,21,22;E-values=1.00e-126,1.80e-36,2.10e-57,1.30e-114,5.60e-43,1.40e-45,1.50e-87,8.10e-24;CoverageSeq=0.77,0.718,0.99,0.821,0.451,0.482,0.954,0.811;CoverageHMM=0.998,0.99,0.95,0.947,0.913,0.951,0.939,0.962;Strand_Interference=1;Strand_Adaptation=NA
SEQF6718.1|JACJSX010000224.1	CCTyper	OPERON	1987	3183	1197	-	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000224.1@1;Genome_ID=SEQF6718.1;Product=Cas Operon;Feature_type=OPERON;Note=Cas Prediction: Type II-D;Complete_Interference=100%;Complete_Adaptation=0%;Best_type=II-D;Best_score=4.0;Genes=Cas9_0_II-D,RT_0_CAS-III-AM-III-B;Positions=3,4;E-values=1.20e-12,2.00e-24;CoverageSeq=0.588,0.796;CoverageHMM=0.113,0.352;Strand_Interference=-1;Strand_Adaptation=NA
SEQF6718.1|JACJSX010000019.1	CCTyper	OPERON	41227	50676	9450	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000019.1@1;Genome_ID=SEQF6718.1;Product=Cas Operon;Feature_type=OPERON;Note=Cas Prediction: Type III-B;Complete_Interference=83%;Complete_Adaptation=NA;Best_type=III-B;Best_score=13.0;Genes=Cas10_0_CAS-III,Cmr3gr5_4_CAS-III-B-III-C,Cmr4_0_IIIB,Cmr5gr11_4_CAS-III-B,Cmr6gr7_0_CAS-III-B-III-C,Csx1_15_CAS-III;Positions=35,36,37,38,39,40;E-values=1.30e-56,1.70e-35,1.10e-38,1.40e-12,8.00e-30,6.40e-13;CoverageSeq=0.692,0.977,0.932,0.932,0.559,0.691;CoverageHMM=0.969,1.0,0.989,0.924,0.673,0.838;Strand_Interference=1;Strand_Adaptation=NA
SEQF6718.1|JACJSX010000029.1	CCTyper	OPERON	36886	38157	1272	-	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000029.1@2;Genome_ID=SEQF6718.1;Product=Cas Operon;Feature_type=OPERON;Note=Cas Prediction: Type II-D;Complete_Interference=100%;Complete_Adaptation=0%;Best_type=II-D;Best_score=4.0;Genes=Cas9_0_II-D;Positions=23;E-values=1.90e-26;CoverageSeq=0.373;CoverageHMM=0.2;Strand_Interference=-1;Strand_Adaptation=NA
SEQF6718.1|JACJSX010000086.1	CCTyper	OPERON	13532	20627	7096	-	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000086.1@2;Genome_ID=SEQF6718.1;Product=Cas Operon;Feature_type=OPERON;Note=Cas Prediction: Type III-B;Complete_Interference=83%;Complete_Adaptation=NA;Best_type=III-B;Best_score=12.0;Genes=PD_DExK_1_CAS-I-II-III-IV-V-VI,Cmr6gr7_0_CAS-III-B-III-C,Cmr5gr11_4_CAS-III-B,Cmr4_0_IIIB,Csm3gr7_2_CAS-III-A-III-D,Cmr3gr5_4_CAS-III-B-III-C,Cas10_0_CAS-III;Positions=19,20,22,23,24,25,26;E-values=1.40e-06,2.80e-18,2.00e-66,5.80e-31,1.30e-09,2.70e-35,4.30e-19;CoverageSeq=0.493,0.897,0.992,0.924,0.64,0.979,0.444;CoverageHMM=0.542,0.482,1.0,0.912,0.317,1.0,0.333;Strand_Interference=-1;Strand_Adaptation=NA
SEQF6718.1|JACJSX010000019.1	CCTyper	CDS	41227	44439	1071	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000019.1_35_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cas10_0_CAS-III;coding_strand=+;E-value=1.3e-56;Score=190.7;Coverage_Seq=0.6918767507002801;Coverage_Hmm=0.9686888454011742
SEQF6718.1|JACJSX010000086.1	CCTyper	CDS	18906	20627	574	-	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000086.1_26_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cas10_0_CAS-III;coding_strand=-;E-value=4.3e-19;Score=66.9;Coverage_Seq=0.4442508710801394;Coverage_Hmm=0.33268101761252444
SEQF6718.1|JACJSX010000016.1	CCTyper	CDS	48254	50563	770	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000016.1_36_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cas10_1_CAS-III;coding_strand=+;E-value=1.2e-109;Score=365.9;Coverage_Seq=0.7116883116883117;Coverage_Hmm=0.8532110091743119
SEQF6718.1|JACJSX010000057.1	CCTyper	CDS	14120	15841	574	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000057.1_12_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cas10_7_CAS-III;coding_strand=+;E-value=1.0000000000000001e-126;Score=421.4;Coverage_Seq=0.7700348432055749;Coverage_Hmm=0.9975609756097561
SEQF6718.1|JACJSX010000057.1	CCTyper	CDS	25780	26754	325	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000057.1_21_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cas1_0_I-II-III;coding_strand=+;E-value=1.5e-87;Score=291.9;Coverage_Seq=0.9538461538461539;Coverage_Hmm=0.9388379204892966
SEQF6718.1|JACJSX010000057.1	CCTyper	CDS	26807	27091	95	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000057.1_22_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cas2_2_CAS-I-II-III-IV-V-VI;coding_strand=+;E-value=8.1e-24;Score=81.8;Coverage_Seq=0.8105263157894737;Coverage_Hmm=0.9620253164556962
SEQF6718.1|JACJSX010000016.1	CCTyper	CDS	54375	55133	253	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000016.1_41_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cas6_8_CAS-I-II-III-IV-V-VI;coding_strand=+;E-value=4.8e-18;Score=63.7;Coverage_Seq=0.5968379446640316;Coverage_Hmm=0.5490909090909091
SEQF6718.1|JACJSX010000029.1	CCTyper	CDS	36886	38157	424	-	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000029.1_23_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cas9_0_II-D;coding_strand=-;E-value=1.9e-26;Score=90.9;Coverage_Seq=0.37264150943396224;Coverage_Hmm=0.20046893317702227
SEQF6718.1|JACJSX010000172.1	CCTyper	CDS	3014	4075	354	-	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000172.1_3_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cas9_0_II-D;coding_strand=-;E-value=3.9999999999999997e-32;Score=109.7;Coverage_Seq=0.4774011299435028;Coverage_Hmm=0.21219226260257915
SEQF6718.1|JACJSX010000224.1	CCTyper	CDS	1987	2481	165	-	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000224.1_3_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cas9_0_II-D;coding_strand=-;E-value=1.2e-12;Score=45.2;Coverage_Seq=0.5878787878787879;Coverage_Hmm=0.11254396248534584
SEQF6718.1|JACJSX010000019.1	CCTyper	CDS	44439	45620	394	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000019.1_36_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cmr3gr5_4_CAS-III-B-III-C;coding_strand=+;E-value=1.6999999999999999e-35;Score=121.2;Coverage_Seq=0.9771573604060914;Coverage_Hmm=1.0
SEQF6718.1|JACJSX010000086.1	CCTyper	CDS	17742	18905	388	-	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000086.1_25_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cmr3gr5_4_CAS-III-B-III-C;coding_strand=-;E-value=2.7e-35;Score=120.6;Coverage_Seq=0.979381443298969;Coverage_Hmm=1.0
SEQF6718.1|JACJSX010000019.1	CCTyper	CDS	45617	46492	292	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000019.1_37_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cmr4_0_IIIB;coding_strand=+;E-value=1.1e-38;Score=131.8;Coverage_Seq=0.9315068493150684;Coverage_Hmm=0.9893992932862191
SEQF6718.1|JACJSX010000086.1	CCTyper	CDS	16623	17372	250	-	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000086.1_23_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cmr4_0_IIIB;coding_strand=-;E-value=5.799999999999999e-31;Score=106.5;Coverage_Seq=0.924;Coverage_Hmm=0.911660777385159
SEQF6718.1|JACJSX010000019.1	CCTyper	CDS	46496	46891	132	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000019.1_38_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cmr5gr11_4_CAS-III-B;coding_strand=+;E-value=1.4e-12;Score=46.3;Coverage_Seq=0.9318181818181818;Coverage_Hmm=0.9242424242424242
SEQF6718.1|JACJSX010000086.1	CCTyper	CDS	16212	16607	132	-	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000086.1_22_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cmr5gr11_4_CAS-III-B;coding_strand=-;E-value=2.0000000000000002e-66;Score=220.5;Coverage_Seq=0.9924242424242424;Coverage_Hmm=1.0
SEQF6718.1|JACJSX010000019.1	CCTyper	CDS	46888	48750	621	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000019.1_39_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cmr6gr7_0_CAS-III-B-III-C;coding_strand=+;E-value=7.999999999999999e-30;Score=102.4;Coverage_Seq=0.5587761674718197;Coverage_Hmm=0.6727941176470589
SEQF6718.1|JACJSX010000086.1	CCTyper	CDS	14565	15527	321	-	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000086.1_20_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Cmr6gr7_0_CAS-III-B-III-C;coding_strand=-;E-value=2.8e-18;Score=64.3;Coverage_Seq=0.897196261682243;Coverage_Hmm=0.48161764705882354
SEQF6718.1|JACJSX010000016.1	CCTyper	CDS	50617	51093	159	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000016.1_37_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Csm2gr11_7_CAS-III-A;coding_strand=+;E-value=5.5e-34;Score=115.7;Coverage_Seq=0.7610062893081762;Coverage_Hmm=0.9818181818181818
SEQF6718.1|JACJSX010000057.1	CCTyper	CDS	18287	19837	517	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000057.1_14_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Csm3gr7_12_CAS-III-A-III-D;coding_strand=+;E-value=1.8e-36;Score=124.5;Coverage_Seq=0.7176015473887815;Coverage_Hmm=0.9899497487437185
SEQF6718.1|JACJSX010000016.1	CCTyper	CDS	51093	52037	315	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000016.1_38_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Csm3gr7_1_CAS-III-A-III-D;coding_strand=+;E-value=2e-73;Score=244.9;Coverage_Seq=0.8444444444444444;Coverage_Hmm=0.9906976744186047
SEQF6718.1|JACJSX010000086.1	CCTyper	CDS	17521	17745	75	-	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000086.1_24_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Csm3gr7_2_CAS-III-A-III-D;coding_strand=-;E-value=1.3e-09;Score=37.0;Coverage_Seq=0.64;Coverage_Hmm=0.31666666666666665
SEQF6718.1|JACJSX010000057.1	CCTyper	CDS	20714	23116	801	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000057.1_17_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Csm3gr7_4_CAS-III-A-III-D;coding_strand=+;E-value=1.3e-114;Score=382.6;Coverage_Seq=0.8214731585518102;Coverage_Hmm=0.946875
SEQF6718.1|JACJSX010000016.1	CCTyper	CDS	52047	53087	347	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000016.1_39_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Csm4gr5_1_CAS-III-A;coding_strand=+;E-value=1.3e-52;Score=177.2;Coverage_Seq=0.9567723342939481;Coverage_Hmm=0.9523809523809523
SEQF6718.1|JACJSX010000016.1	CCTyper	CDS	53099	54367	423	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000016.1_40_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Csm5gr7_0_CAS-III-A-III-D;coding_strand=+;E-value=3.1e-23;Score=80.8;Coverage_Seq=0.8605200945626478;Coverage_Hmm=0.8712328767123287
SEQF6718.1|JACJSX010000057.1	CCTyper	CDS	23178	24302	375	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000057.1_18_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Csm6_2_CAS-III;coding_strand=+;E-value=5.6e-43;Score=144.6;Coverage_Seq=0.45066666666666666;Coverage_Hmm=0.9130434782608695
SEQF6718.1|JACJSX010000057.1	CCTyper	CDS	24324	25424	367	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000057.1_19_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Csm6_2_CAS-III;coding_strand=+;E-value=1.4e-45;Score=153.1;Coverage_Seq=0.4822888283378747;Coverage_Hmm=0.9510869565217391
SEQF6718.1|JACJSX010000057.1	CCTyper	CDS	20133	20714	194	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000057.1_16_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Csx19_1_CAS-III-D;coding_strand=+;E-value=2.1000000000000002e-57;Score=191.9;Coverage_Seq=0.9896907216494846;Coverage_Hmm=0.95
SEQF6718.1|JACJSX010000019.1	CCTyper	CDS	48754	50676	641	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000019.1_40_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Csx1_15_CAS-III;coding_strand=+;E-value=6.4e-13;Score=46.5;Coverage_Seq=0.6911076443057722;Coverage_Hmm=0.8375527426160337
SEQF6718.1|JACJSX010000016.1	CCTyper	CDS	55148	56425	426	+	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000016.1_42_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : Csx1_18_CAS-III;coding_strand=+;E-value=3.4e-79;Score=265.3;Coverage_Seq=0.8943661971830986;Coverage_Hmm=1.0
SEQF6718.1|JACJSX010000086.1	CCTyper	CDS	13532	14176	215	-	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000086.1_19_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : PD_DExK_1_CAS-I-II-III-IV-V-VI;coding_strand=-;E-value=1.4e-06;Score=26.2;Coverage_Seq=0.4930232558139535;Coverage_Hmm=0.541871921182266
SEQF6718.1|JACJSX010000224.1	CCTyper	CDS	2758	3183	142	-	.	ID=SEQF6718.1|JACJSX010000224.1_4_cas;Genome_ID=SEQF6718.1;Feature_type=CDS;Product=Cas Prediction : RT_0_CAS-III-AM-III-B;coding_strand=-;E-value=2.0000000000000002e-24;Score=84.2;Coverage_Seq=0.795774647887324;Coverage_Hmm=0.3523489932885906