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Taxonomy: V4.3   |  16S rRNA RefSeq: V16.03   |  Genomic RefSeq: V11.03   |  Viruses: V1.2

BAKTAGenome Explorer: Bifidobacterium subtile (GCA_000426405.1)

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BAKTA Annotations for GCA_000426405.1
Genome Selected: Bifidobacterium subtile
ContigsBases CDSrRNA tmRNAtRNA
32 2765266 2255 3 1 47
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Region Protein-ID Type Genome
Viewer		 Range
(bp)		 Show Sequences
(length) NA / AA		 BAKTA
Gene		 BAKTA
GeneProduct
4501 AUFH01000017.1 GCA000426405_02247 CDS open 1141-2466 _na     441_aa hypothetical protein
4502 AUFH01000017.1 GCA000426405_02248 CDS open 2490-4226 _na     578_aa hypothetical protein
4503 AUFH01000017.1 GCA000426405_02249 CDS open 4304-7870 _na     1188_aa recQ ATP-dependent DNA helicase recQ
4504 AUFH01000017.1 GCA000426405_02250 CDS open 7947-9053 _na     368_aa DUF1156 domain-containing protein
4505 AUFH01000017.1 GCA000426405_02251 CDS open 9099-10742 _na     547_aa DUF1156 domain-containing protein
4506 AUFH01000017.1 GCA000426405_02252 CDS open 10777-14268 _na     1163_aa ATPase AAA
4507 AUFH01000017.1 GCA000426405_02253 CDS open 14400-14879 _na     159_aa Transposase subunit B
4508 AUFH01000017.1 GCA000426405_02254 CDS open 15342-15644 _na     100_aa IS3/IS911 family transposase
4509 AUFH01000017.1 GCA000426405_02255 CDS open 15782-16348 _na     188_aa Oxidoreductase
4510 AUFH01000017.1 GCA000426405_02256 CDS open 16411-16956 _na     181_aa Integrase
4511 AUFH01000017.1 GCA000426405_02245 gene open 77-595
4512 AUFH01000017.1 GCA000426405_02246 gene open 561-1109
4513 AUFH01000017.1 GCA000426405_02247 gene open 1141-2466
4514 AUFH01000017.1 GCA000426405_02248 gene open 2490-4226
4515 AUFH01000017.1 GCA000426405_02249 gene open 4304-7870 recQ
4516 AUFH01000017.1 GCA000426405_02250 gene open 7947-9053
4517 AUFH01000017.1 GCA000426405_02251 gene open 9099-10742
4518 AUFH01000017.1 GCA000426405_02252 gene open 10777-14268
4519 AUFH01000017.1 GCA000426405_02253 gene open 14400-14879
4520 AUFH01000017.1 GCA000426405_02254 gene open 15342-15644
4521 AUFH01000017.1 GCA000426405_02255 gene open 15782-16348
4522 AUFH01000017.1 GCA000426405_02256 gene open 16411-16956
4523 AUFH01000018.1 GCA000426405_02257 CDS open 15-260 _na     81_aa IstB-like ATP-binding protein
4524 AUFH01000018.1 GCA000426405_02258 CDS open 322-1029 _na     235_aa hypothetical protein
4525 AUFH01000018.1 GCA000426405_02259 CDS open 1361-5662 _na     1433_aa Peptidase
4526 AUFH01000018.1 GCA000426405_02260 CDS open 5828-6925 _na     365_aa Membrane protein involved in colicin uptake
4527 AUFH01000018.1 GCA000426405_02261 CDS open 7102-7596 _na     164_aa Transmembrane protein
4528 AUFH01000018.1 GCA000426405_02262 CDS open 7635-8039 _na     134_aa hypothetical protein
4529 AUFH01000018.1 GCA000426405_02263 CDS open 8071-8367 _na     98_aa hypothetical protein
4530 AUFH01000018.1 GCA000426405_02257 gene open 15-260
4531 AUFH01000018.1 GCA000426405_02258 gene open 322-1029
4532 AUFH01000018.1 GCA000426405_02259 gene open 1361-5662
4533 AUFH01000018.1 GCA000426405_02260 gene open 5828-6925
4534 AUFH01000018.1 GCA000426405_02261 gene open 7102-7596
4535 AUFH01000018.1 GCA000426405_02262 gene open 7635-8039
4536 AUFH01000018.1 GCA000426405_02263 gene open 8071-8367
4537 AUFH01000019.1 GCA000426405_02264 CDS open 9-743 _na     244_aa IS3 family transposase
4538 AUFH01000019.1 GCA000426405_02265 CDS open 1006-1305 _na     99_aa Transposase
4539 AUFH01000019.1 GCA000426405_02266 CDS open 1305-2228 _na     307_aa IS3 family transposase
4540 AUFH01000019.1 GCA000426405_02267 CDS open 2393-3577 _na     394_aa Glycosyltransferase%2C group 1 family protein
4541 AUFH01000019.1 GCA000426405_02268 CDS open 3589-5124 _na     511_aa rfbX Polysaccharide biosynthesis protein
4542 AUFH01000019.1 GCA000426405_02264 gene open 9-743
4543 AUFH01000019.1 GCA000426405_02265 gene open 1006-1305
4544 AUFH01000019.1 GCA000426405_02266 gene open 1305-2228
4545 AUFH01000019.1 GCA000426405_02267 gene open 2393-3577
4546 AUFH01000019.1 GCA000426405_02268 gene open 3589-5124 rfbX
4547 AUFH01000020.1 GCA000426405_02269 CDS open 22-180 _na     52_aa hypothetical protein
4548 AUFH01000020.1 GCA000426405_02270 CDS open 164-409 _na     81_aa hypothetical protein
4549 AUFH01000020.1 GCA000426405_02271 CDS open 487-2388 _na     633_aa Cation transport ATPase
4550 AUFH01000020.1 GCA000426405_02272 CDS open 2450-2680 _na     76_aa Heavy-metal-associated domain protein
4551 AUFH01000020.1 GCA000426405_02273 CDS open 2680-3267 _na     195_aa DNA-binding protein
4552 AUFH01000020.1 GCA000426405_02274 CDS open 3335-4057 _na     240_aa Cyclic nucleotide-binding protein
4553 AUFH01000020.1 GCA000426405_02275 CDS open 4206-4754 _na     182_aa DUF559 domain-containing protein
4554 AUFH01000020.1 GCA000426405_02276 CDS open 4850-5167 _na     105_aa Transposase
4555 AUFH01000020.1 GCA000426405_02269 gene open 22-180
4556 AUFH01000020.1 GCA000426405_02270 gene open 164-409
4557 AUFH01000020.1 GCA000426405_02271 gene open 487-2388
4558 AUFH01000020.1 GCA000426405_02272 gene open 2450-2680
4559 AUFH01000020.1 GCA000426405_02273 gene open 2680-3267
4560 AUFH01000020.1 GCA000426405_02274 gene open 3335-4057
4561 AUFH01000020.1 GCA000426405_02275 gene open 4206-4754
4562 AUFH01000020.1 GCA000426405_02276 gene open 4850-5167
4563 AUFH01000021.1 GCA000426405_02277 CDS open 65-289 _na     74_aa IS3 family transposase
4564 AUFH01000021.1 GCA000426405_02278 CDS open 559-1491 _na     310_aa IS3509a transposase
4565 AUFH01000021.1 GCA000426405_02279 CDS open 2043-2909 _na     288_aa O-antigen polymerase superfamily protein
4566 AUFH01000021.1 GCA000426405_02280 CDS open 3228-4337 _na     369_aa Glycosyl transferase
4567 AUFH01000021.1 GCA000426405_02281 CDS open 4334-4840 _na     168_aa hypothetical protein
4568 AUFH01000021.1 GCA000426405_02277 gene open 65-289
4569 AUFH01000021.1 GCA000426405_02278 gene open 559-1491
4570 AUFH01000021.1 GCA000426405_02279 gene open 2043-2909
4571 AUFH01000021.1 GCA000426405_02280 gene open 3228-4337
4572 AUFH01000021.1 GCA000426405_02281 gene open 4334-4840
4573 AUFH01000022.1 GCA000426405_02282 CDS open 190-4476 _na     1428_aa Putative surface-anchored fimbrial subunit
4574 AUFH01000022.1 GCA000426405_02282 gene open 190-4476
4575 AUFH01000023.1 GCA000426405_02283 CDS open 37-630 _na     197_aa hypothetical protein
4576 AUFH01000023.1 GCA000426405_02284 CDS open 648-1232 _na     194_aa Death-on-curing protein
4577 AUFH01000023.1 GCA000426405_02285 CDS open 1225-1731 _na     168_aa Antitoxin SocA-like Panacea domain-containing protein
4578 AUFH01000023.1 GCA000426405_02286 CDS open 2243-2644 _na     133_aa DUF2513 domain-containing protein
4579 AUFH01000023.1 GCA000426405_02287 CDS open 3399-4343 _na     314_aa Transposase
4580 AUFH01000023.1 GCA000426405_02283 gene open 37-630
4581 AUFH01000023.1 GCA000426405_02284 gene open 648-1232
4582 AUFH01000023.1 GCA000426405_02285 gene open 1225-1731
4583 AUFH01000023.1 GCA000426405_02286 gene open 2243-2644
4584 AUFH01000023.1 GCA000426405_02287 gene open 3399-4343
4585 AUFH01000024.1 GCA000426405_02288 CDS open 270-1346 _na     358_aa Sortase
4586 AUFH01000024.1 GCA000426405_02289 CDS open 1346-2368 _na     340_aa Collagen adhesin
4587 AUFH01000024.1 GCA000426405_02290 CDS open 2786-4288 _na     500_aa Sortase-anchored surface protein
4588 AUFH01000024.1 GCA000426405_02291 CDS open 4339-4563 _na     74_aa IS3 family transposase
4589 AUFH01000024.1 GCA000426405_02288 gene open 270-1346
4590 AUFH01000024.1 GCA000426405_02289 gene open 1346-2368
4591 AUFH01000024.1 GCA000426405_02290 gene open 2786-4288
4592 AUFH01000024.1 GCA000426405_02291 gene open 4339-4563
4593 AUFH01000025.1 GCA000426405_02292 CDS open 360-488 _na     42_aa Transposase
4594 AUFH01000025.1 GCA000426405_02293 CDS open 531-905 _na     124_aa polysaccharide pyruvyl transferase family protein
4595 AUFH01000025.1 GCA000426405_02294 CDS open 1002-1637 _na     211_aa polysaccharide pyruvyl transferase family protein
4596 AUFH01000025.1 GCA000426405_02295 CDS open 1683-2867 _na     394_aa Na-driven multidrug efflux pump
4597 AUFH01000025.1 GCA000426405_02292 gene open 360-488
4598 AUFH01000025.1 GCA000426405_02293 gene open 531-905
4599 AUFH01000025.1 GCA000426405_02294 gene open 1002-1637
4600 AUFH01000025.1 GCA000426405_02295 gene open 1683-2867
4601 AUFH01000026.1 GCA000426405_02296 CDS open 140-244 _na     34_aa hypothetical protein
4602 AUFH01000026.1 GCA000426405_02297 CDS open 866-2362 _na     498_aa Mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)
4603 AUFH01000026.1 GCA000426405_02298 CDS open 2465-2674 _na     69_aa hypothetical protein
4604 AUFH01000026.1 GCA000426405_02296 gene open 140-244
4605 AUFH01000026.1 GCA000426405_02297 gene open 866-2362
4606 AUFH01000026.1 GCA000426405_02298 gene open 2465-2674
4607 AUFH01000027.1 GCA000426405_02299 CDS open 178-465 _na     95_aa Putative general stress protein 30
4608 AUFH01000027.1 GCA000426405_02300 CDS open 484-1014 _na     176_aa Serine acetyltransferase
4609 AUFH01000027.1 GCA000426405_02301 CDS open 1026-2135 _na     369_aa Putative general stress protein 30
4610 AUFH01000027.1 GCA000426405_02302 CDS open 2183-2503 _na     106_aa Na-driven multidrug efflux pump
4611 AUFH01000027.1 GCA000426405_02299 gene open 178-465
4612 AUFH01000027.1 GCA000426405_02300 gene open 484-1014
4613 AUFH01000027.1 GCA000426405_02301 gene open 1026-2135
4614 AUFH01000027.1 GCA000426405_02302 gene open 2183-2503
4615 AUFH01000028.1 GCA000426405_02303 CDS open 61-846 _na     261_aa istB IS21-like element helper ATPase IstB
4616 AUFH01000028.1 GCA000426405_02304 CDS open 843-2258 _na     471_aa istA IS21 family transposase
4617 AUFH01000028.1 GCA000426405_02303 gene open 61-846 istB
4618 AUFH01000028.1 GCA000426405_02304 gene open 843-2258 istA
4619 AUFH01000029.1 GCA000426405_02305 CDS open 185-298 _na     37_aa hypothetical protein
4620 AUFH01000029.1 GCA000426405_02306 CDS open 937-1203 _na     88_aa DNA-damage-inducible protein J
4621 AUFH01000029.1 GCA000426405_02307 CDS open 1206-1496 _na     96_aa relE Translation repressor RelE
4622 AUFH01000029.1 GCA000426405_02305 gene open 185-298
4623 AUFH01000029.1 GCA000426405_02306 gene open 937-1203
4624 AUFH01000029.1 GCA000426405_02307 gene open 1206-1496 relE
4625 AUFH01000030.1 GCA000426405_02308 CDS open 219-1577 _na     452_aa IS256 family transposase
4626 AUFH01000030.1 GCA000426405_02308 gene open 219-1577
4627 AUFH01000031.1 GCA000426405_02309 CDS open 51-1406 _na     451_aa IS3 family transposase
4628 AUFH01000031.1 GCA000426405_02309 gene open 51-1406
4629 AUFH01000032.1 GCA000426405_02310 CDS open 239-601 _na     120_aa yccF YccF domain-containing protein
4630 AUFH01000032.1 GCA000426405_02311 CDS open 782-958 _na     58_aa YHS domain-containing protein
4631 AUFH01000032.1 GCA000426405_02310 gene open 239-601 yccF
4632 AUFH01000032.1 GCA000426405_02311 gene open 782-958