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Taxonomy: V4.3   |  16S rRNA RefSeq: V16.03   |  Genomic RefSeq: V11.03   |  Viruses: V1.2

NCBIGenome Explorer: Aggregatibacter actinomycetemcomitans (GCA_008084095.1)

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NCBI Annotations for GCA_008084095.1
Genome Selected: Aggregatibacter actinomycetemcomitans
ContigsBases CDSrRNA tmRNAtRNA
29 2038882
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Region Protein-ID Type Genome
Viewer		 Range
(bp)		 Show Sequences
(length) NA / AA		 NCBI
Gene		 NCBI
GeneProduct
4001 VSEV01000015.1 gene open 2029-2304 rpsS
4002 VSEV01000015.1 gene open 2330-3151 rplB
4003 VSEV01000015.1 gene open 3172-3474 rplW
4004 VSEV01000015.1 gene open 3471-4073 rplD
4005 VSEV01000015.1 gene open 4089-4715 rplC
4006 VSEV01000015.1 gene open 4732-5043 rpsJ
4007 VSEV01000015.1 gene open 5295-6191
4008 VSEV01000015.1 gene open 6466-7119 atoD
4009 VSEV01000015.1 gene open 7131-7781
4010 VSEV01000015.1 gene open 7784-9127
4011 VSEV01000015.1 gene open 9145-10326
4012 VSEV01000015.1 gene open 10424-10891
4013 VSEV01000015.1 gene open 10982-12511
4014 VSEV01000015.1 gene open 12628-13560 arcC
4015 VSEV01000015.1 gene open 13570-14574
4016 VSEV01000015.1 gene open 14817-16208
4017 VSEV01000015.1 gene open 16211-17194 dusA
4018 VSEV01000015.1 gene open 17250-18242
4019 VSEV01000015.1 gene open 18408-18860 asnC
4020 VSEV01000015.1 gene open 18894-19652
4021 VSEV01000015.1 gene open 19790-20851
4022 VSEV01000015.1 gene open 20925-21275 arsC
4023 VSEV01000015.1 gene open 21379-21741
4024 VSEV01000015.1 gene open 21692-21976
4025 VSEV01000015.1 gene open 22185-23516 rimO
4026 VSEV01000015.1 gene open 23551-24045
4027 VSEV01000015.1 gene open 24172-24390
4028 VSEV01000015.1 gene open 24462-25058
4029 VSEV01000015.1 gene open 25153-25872
4030 VSEV01000015.1 gene open 25923-26357 rraB
4031 VSEV01000015.1 gene open 26452-26847 mscL
4032 VSEV01000015.1 gene open 26957-28333 trkA
4033 VSEV01000015.1 gene open 28357-29712 rsmB
4034 VSEV01000015.1 gene open 29712-30668
4035 VSEV01000015.1 gene open 30734-31246 def
4036 VSEV01000016.1 gene open 3-1370 pssA
4037 VSEV01000016.1 gene open 1556-2632
4038 VSEV01000016.1 gene open 2698-2958
4039 VSEV01000016.1 gene open 3026-3721
4040 VSEV01000016.1 gene open 3834-4997
4041 VSEV01000016.1 gene open 5062-6141 fbaA
4042 VSEV01000016.1 gene open 6349-7491
4043 VSEV01000016.1 gene open 7484-8407
4044 VSEV01000016.1 gene open 8445-9263
4045 VSEV01000016.1 pseudogene open 9487-10314
4046 VSEV01000016.1 gene open 10508-10915
4047 VSEV01000016.1 gene open 10966-11382
4048 VSEV01000016.1 gene open 11516-12451 ftsX
4049 VSEV01000016.1 gene open 12460-13110 ftsE
4050 VSEV01000017.1 gene open 119-508 rplQ
4051 VSEV01000017.1 gene open 550-1539 rpoA
4052 VSEV01000017.1 gene open 1568-2188 rpsD
4053 VSEV01000017.1 gene open 2218-2607 rpsK
4054 VSEV01000017.1 gene open 2623-2979 rpsM
4055 VSEV01000017.1 gene open 3121-3234 rpmJ
4056 VSEV01000017.1 gene open 3260-4585 secY
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4058 VSEV01000017.1 gene open 5027-5206 rpmD
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4060 VSEV01000017.1 gene open 5729-6082 rplR
4061 VSEV01000017.1 gene open 6096-6629 rplF
4062 VSEV01000017.1 gene open 6645-7037 rpsH
4063 VSEV01000017.1 gene open 7074-7379 rpsN
4064 VSEV01000017.1 gene open 7392-7931 rplE
4065 VSEV01000017.1 gene open 7949-8260 rplX
4066 VSEV01000017.1 gene open 8271-8642 rplN
4067 VSEV01000018.1 gene open 38-643
4068 VSEV01000018.1 gene open 1381-1578
4069 VSEV01000018.1 gene open 1550-2587
4070 VSEV01000018.1 gene open 2769-4187 aspA
4071 VSEV01000018.1 gene open 4417-4899 fxsA
4072 VSEV01000018.1 gene open 4986-5276
4073 VSEV01000018.1 gene open 5397-7040 groL
4074 VSEV01000018.1 gene open 7129-7986 folD
4075 VSEV01000018.1 gene open 8143-8219
4076 VSEV01000018.1 gene open 8253-8329
4077 VSEV01000019.1 gene open 90-464
4078 VSEV01000019.1 gene open 485-922
4079 VSEV01000019.1 gene open 922-1956
4080 VSEV01000019.1 gene open 2066-2407
4081 VSEV01000019.1 pseudogene open 2542-2769
4082 VSEV01000019.1 gene open 2829-3683
4083 VSEV01000019.1 gene open 3694-4755
4084 VSEV01000019.1 gene open 4757-6223
4085 VSEV01000019.1 gene open 6303-6521
4086 VSEV01000019.1 pseudogene open 6496-6822
4087 VSEV01000019.1 gene open 6851-7333
4088 VSEV01000020.1 gene open 323-1552
4089 VSEV01000020.1 gene open 1682-2365
4090 VSEV01000020.1 gene open 2381-3652 nadR
4091 VSEV01000020.1 pseudogene open 3703-3953
4092 VSEV01000020.1 gene open 3972-4217 tusA
4093 VSEV01000020.1 pseudogene open 4194-4576
4094 VSEV01000020.1 gene open 4607-4822
4095 VSEV01000020.1 gene open 4841-6304
4096 VSEV01000020.1 gene open 6304-6816 hemG
4097 VSEV01000021.1 gene open 182-3057
4098 VSEV01000022.1 gene open 153-1696
4099 VSEV01000023.1 pseudogene open 607-963
4100 VSEV01000023.1 gene open 1249-1470
4101 VSEV01000024.1 gene open 1-1150 tuf
4102 VSEV01000025.1 gene open 1-812
4103 VSEV01000026.1 gene open 1-644
4104 VSEV01000027.1 pseudogene open 34-486
4105 VSEV01000028.1 gene open 1-114 rrf
4106 VSEV01000028.1 gene open 385-550
4107 VSEV01000029.1 gene open 105-365
4108 VSEV01000029.1 gene open 407-508
4109 VSEV01000001.1 sequence_feature open 210394-210523
4110 VSEV01000002.1 riboswitch open 123241-123285
4111 VSEV01000002.1 riboswitch open 200742-200829
4112 VSEV01000003.1 riboswitch open 91026-91174
4113 VSEV01000007.1 riboswitch open 75427-75575
4114 VSEV01000008.1 riboswitch open 45540-45723
4115 VSEV01000001.1 SRP_RNA open 13064-13162 ffs signal recognition particle sRNA small type
4116 VSEV01000001.1 tRNA open 122910-122986 tRNA-Asp
4117 VSEV01000001.1 tRNA open 123009-123085 tRNA-Asp
4118 VSEV01000001.1 tRNA open 184240-184316 tRNA-Lys
4119 VSEV01000001.1 tRNA open 184342-184417 tRNA-Lys
4120 VSEV01000001.1 tRNA open 184444-184519 tRNA-Lys
4121 VSEV01000001.1 tRNA open 232490-232579 tRNA-Ser
4122 VSEV01000001.1 tRNA open 239934-240009 tRNA-Gly
4123 VSEV01000001.1 tRNA open 240018-240091 tRNA-Cys
4124 VSEV01000001.1 tRNA open 250149-250225 tRNA-Met
4125 VSEV01000002.1 tRNA open 22091-22166 tRNA-Gly
4126 VSEV01000002.1 tRNA open 217664-217740 tRNA-Met
4127 VSEV01000002.1 tRNA open 217746-217830 tRNA-Leu
4128 VSEV01000002.1 tRNA open 217860-217934 tRNA-Gln
4129 VSEV01000002.1 tRNA open 217972-218046 tRNA-Gln
4130 VSEV01000002.1 tRNA open 246900-246976 tRNA-Met
4131 VSEV01000003.1 tRNA open 120626-120701 tRNA-Ala
4132 VSEV01000003.1 tRNA open 122511-122586 tRNA-Val
4133 VSEV01000003.1 tRNA open 122625-122700 tRNA-Val
4134 VSEV01000003.1 tRNA open 122728-122803 tRNA-Val
4135 VSEV01000004.1 tRNA open 95-170 tRNA-Thr
4136 VSEV01000004.1 tRNA open 174-248 tRNA-Gly
4137 VSEV01000004.1 tRNA open 289-373 tRNA-Tyr
4138 VSEV01000004.1 tRNA open 404-479 tRNA-Thr
4139 VSEV01000004.1 tRNA open 29382-29458 tRNA-Ile
4140 VSEV01000004.1 tRNA open 101522-101607 tRNA-Leu
4141 VSEV01000004.1 tRNA open 130885-130971 tRNA-Leu
4142 VSEV01000004.1 tRNA open 186673-186748 tRNA-Lys
4143 VSEV01000004.1 tRNA open 186801-186887 tRNA-Leu
4144 VSEV01000004.1 tRNA open 186889-186964 tRNA-Gly
4145 VSEV01000005.1 ncRNA open 133316-133499 ssrS 6S RNA
4146 VSEV01000006.1 tRNA open 31-107 tRNA-Pro
4147 VSEV01000006.1 tRNA open 110-185 tRNA-His
4148 VSEV01000006.1 tRNA open 217-293 tRNA-Arg
4149 VSEV01000006.1 tRNA open 50101-50176 tRNA-Asn
4150 VSEV01000006.1 tRNA open 123760-123845 tRNA-Leu
4151 VSEV01000007.1 RNase_P_RNA open 39408-39796 rnpB RNase P RNA component class A
4152 VSEV01000007.1 tRNA open 95191-95267 tRNA-Val
4153 VSEV01000008.1 tRNA open 76477-76553 tRNA-Arg
4154 VSEV01000008.1 tRNA open 76608-76684 tRNA-Arg
4155 VSEV01000008.1 tRNA open 76702-76795 tRNA-Ser
4156 VSEV01000009.1 tRNA open 81920-81995 tRNA-Asn
4157 VSEV01000009.1 tRNA open 82000-82075 tRNA-Phe
4158 VSEV01000010.1 tRNA open 59883-59972 tRNA-Ser
4159 VSEV01000010.1 tRNA open 77880-77955 tRNA-Trp
4160 VSEV01000010.1 tRNA open 77990-78066 tRNA-Asp
4161 VSEV01000010.1 rRNA open 78075-78190 rrf 5S ribosomal RNA
4162 VSEV01000011.1 tmRNA open 11584-11949 ssrA transfer-messenger RNA
4163 VSEV01000011.1 tRNA open 76336-76430 tRNA-Sec
4164 VSEV01000018.1 tRNA open 8143-8219 tRNA-Pro
4165 VSEV01000018.1 tRNA open 8253-8329 tRNA-Arg
4166 VSEV01000021.1 rRNA open 182-3057 23S ribosomal RNA
4167 VSEV01000022.1 rRNA open 153-1696 16S ribosomal RNA
4168 VSEV01000028.1 rRNA open 1-114 rrf 5S ribosomal RNA
4169 VSEV01000028.1 rRNA open 385-550 23S ribosomal RNA
4170 VSEV01000001.1 region open 1-308657
4171 VSEV01000002.1 region open 1-284397
4172 VSEV01000003.1 region open 1-220449
4173 VSEV01000004.1 region open 1-213987
4174 VSEV01000005.1 region open 1-169574
4175 VSEV01000006.1 region open 1-135742
4176 VSEV01000007.1 region open 1-114438
4177 VSEV01000008.1 region open 1-104095
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